Четвертинні амонієві сполуки по широті антибактеріального спектру поступаються хлоровмісних речовин та похідних фенолу, але хороша розчинність у воді, відсутність запаху, а також корозійні властивості, порівняно невисока токсичність для людини роблять ці сполуки цінними дезінфікуючими засобами. Четвертинні амонієві сполуки ефективні у відношенні бактерій і грибів.
Мікобактерії туберкульозу і спори бактерій стійкі до дії навіть концентрованих розчинів, у зв'язку з чим ці речовини не застосовують для знезараження при туберкульозі, сибірки та ін
Найбільш активними вітчизняними препаратами цієї групи сполук є катапин і катионат, що володіють бактерицидною активністю 0,5 - 1% розчинах. Препарати застосовують для дезінфекції при кишкових захворюваннях, для знезараження в пологових будинках, на заводах медичних препаратів і т. п.
