Велике значення при виходжуванні недоношених дітей надається профілактиці різних інфекцій (респіраторно-вірусних, гнійних, кишкових). Джерелом зараження може бути мати, обслуговуючий персонал або хвора дитина. Крім того, погана прибирання приміщення призводить до забруднення палат, що в свою чергу сприяє захворюванню дітей.
Санітарно-епідемічний режим представляє з себе певний комплекс профілактичних заходів, спрямованих на попередження зараження дитини. Він складається з санітарно-гігієнічного та епідемічного режимів. Санітарно-гігієнічний режим включає в себе прибирання приміщення і дотримання обслуговуючим персоналом і матерями правил особистої гігієни. Сутність епідемічного режиму полягає у своєчасній ізоляції хворих і оберігання від захворювання контактних дітей.
Дитяче відділення пологового будинку має бути повністю ізольовано від допологового, післяпологового та гінекологічного відділень, а відділення для недоношених дітей, розташоване на базі дитячої лікарні, має бути повністю ізольовано від інших відділень лікарні. Всім стороннім особам категорично забороняється без відповідного дозволу входити в дитяче відділення. При вирішенні сторонній людині відвідати дитяче відділення він повинен одягнути чистий халат, маску, ковпак (косинку), тапочки або бахіли (гумові чоботи, які надягають на вуличне взуття). Персонал, обслуговуючий дитячі палати, при виході з дитячого відділення в інші приміщення пологового будинку (лікарні) повинен надіти вихідний халат. Ці вихідні халати висять біля виходу з відділення в окремій шафі або на вішалці.
