Після тривалого вживання алкоголю виникає розлад внутрішніх органів, порушується обмін речовин. Серйозно уражається нервово-ендокринна регуляція і пов'язана з нею статева функція. З внутрішніх органів особливо сильно страждають серцево-судинна система, печінка, шлунок і легені. Знижуючи окислювальні процеси, алкоголь тим самим сприяє ожирінню м'язи серця, що викликає ослаблення її скоротливої здатності. У осіб, що тривало вживають алкоголь, рано виникають і несприятливо протікають такі грізні захворювання, як інфаркт міокарда, коронарокардіосклероз, гіпертонічна хвороба. Навіть невеликі дози спиртного здатні викликати у підлітків зміна пульсу, артеріального тиску та інших показників серцевої діяльності, що закономірно виявляється за допомогою електрокардіографічного дослідження. Рідше реєструються гострі порушення коронарного кровообігу. Звичного вживання алкоголю зазвичай супроводжує кисневе голодування і як наслідок - порушення вуглеводного, жирового та білкового обмінів, виснаження вітамінного балансу.
Серед захворювань печінки найбільш небезпечні алкогольні цирози, коли дефект на місці загиблих печінкових клітин заміщається сполучною тканиною. При цирозі печінка перестає виконувати свою функцію по знешкодженню ендогенних і екзогенних отрут, синтезу важливих білкових сполук (наприклад, протромбіну, бере участь в згортанні крові), накопичення і депонування глікогену і багатьох важливих вітамінів - А, В), і До інших. Дефіцит цих вітамінів відповідно призводить до розвитку у алкоголіків курячої сліпоти (нездатність розрізняти предмети в темряві), множинного запалення периферичних і черепно-мозкових нервів (поліневрити), кровотеч. Зниження знешкоджуючій функції печінки зумовлено також часто зустрічається її ожирінням (95,3% В. В. Давыдовскому), що в свою чергу визначає різке зниження толерантності (опірності) організму на введення алкоголю і більш швидку психічну деградацію особи.
Значна доза і висока концентрація алкоголю (спирт, горілка, коньяк і особливо самогон внаслідок великої кількості в ньому сивушних масел) чинять шкідливий вплив на слизові оболонки органів травлення. Алкоголь домінує серед причин гастритів і факторів, загострювальних перебіг виразкової хвороби шлунка і дванадцятипалої кишки. Загибель клітин слизової оболонки шлунка, їх дегенеративні зміни і атиповий зростання зазвичай передують злоякісного переродження клітин - розвитку раку.
Тривале виділення алкоголю з видихуваним повітрям чинить токсичну і подразнювальний вплив на слизові оболонки легеневої тканини і дихальних шляхів. Хронічні запальні процеси глотки (фарингіти), гортані (ларингіт), трахеї, бронхів і легенів (пневмонії) виникають у підлітків і юнаків, які вживають алкоголь, в 3-4 рази частіше в порівнянні з непитущими.
Виключно важливе місце належить впливу алкоголю на нервову систему, особливо на слабку, не закончившую формування, вищу нервову діяльність дітей і підлітків. Для них доза, рівна 3-4 мілілітрів чистого алкоголю на 1 кілограм ваги, може стати причиною смерті, яка настає внаслідок паралічу життєво важливих нервових центрів і пов'язаних з ними органів.
Вчені довели також згубний вплив алкоголю На сексуальну функцію і статеві залози. Вся сукупність чуттєвих сприйнять, пов'язаних з сексуальними переживаннями, як і загальна сфера емоційних стосунків, стає елементарною, примітивної, грубою. Молодим людям, пристрастившимся до вживання алкоголю, бувають чужі високі духовні пориви; вони ніколи не пізнають піднесеної і натхненної любові. Нетактовність і грубість, відсутність критики до свого стану все більшою мірою тягнуть за собою наполегливе прагнення до негайної реалізації статевого потягу, незважаючи часом на присутність дітей і сторонніх осіб.