Затримка окремих стадій ембріогенезу дає ряд вад розвитку, вроджених захворювань шиї. До них відносяться: шийні ребра, серединні і бокові кісти і нориці. Бранхиогенная кіста (див.), дермоїдні кісти, кривошея (див.), крилоподібний шия.
Шийні ребра (частіше наVII) можуть бути односторонніми і двосторонніми. Вони є результатом затримки зворотного розвитку ембріональних зачатків шийних ребер. Шийні ребра бувають різної довжини, вільні або поєднані з I ребром. В залежності від довжини і напрямку ребер виникають і розлади. Шийні ребра можуть викликати викривлення хребта в шийному відділі, так і в інших відділах. Симптоми виявляються частіше при різких рухах та після травм. У таких хворих спостерігаються різко опущені плечі. Лікування тільки оперативне.
Серединні і бокові кісти шиї (hygroma colli congenitum) і шийні нориці виникають в результаті неповної еволюції зябрових дуг і щілин в ембріональному періоді і порушення облітерації і атрофії зобно-глоткових і щитовидно-язичного проток. Серединні кісти шиї щільно пов'язані з під'язикової кісткою. Лікування кіст і нориць тільки оперативне, при серединних кіст часто з резекцією під'язикової кістки.