Перелік цих захворювань збільшується в міру поліпшення і вдосконалення методів імунологічного дослідження. Успіхи у вивченні аутоалергічних захворювань в клініці пов'язані з застосуванням методу флюоресценції Кунса. Цей метод дозволяє фіксувати на молекулі антигенів або антитіл флуоресцентну речовина, з допомогою якого легко простежити фіксацію антигенів і антитіл в тканинах.
Можна з упевненістю сказати, що багато захворювання крові, такі, як гемолітична анемія, пароксизмальна гемоглобінурія, пурпура з лизисом тромбоцитів, гломерулонефрити, мають аутоімунний генез. У клініці нерідко спостерігаються хронічні тиреоїдити аутоімунного генезу. Нарешті, тяжке системне захворювання - червона дисемінована вовчак - також має аутоімунний генез: при цьому захворюванні утворюються різні антитіла, спрямовані проти багатьох нормальних тканин організму. Серед них найбільш вивчені антиядерні антитіла - аутоантитіла проти дезоксирибонуклеїнової кислоти (ДНК), яка міститься в ядрах клітин. Ці антитіла утворюють розетку, звану також кліткою LE Харгрейвса. LE-клітини (люпус еритематозні) являють собою полинуклеарные лейкоцити з поглиненими ядрами інших лейкоцитів, пошкоджених під впливом антиядерних антитіл.
Такі захворювання, як гломерулонефрит, який розвинувся після стрептококової інфекції, ревматичний кардит, хронічний неспецифічний прогресуючий поліартрит, склеродермія, дерматоміозит, вузликовий періартеріїт, тяжка міастенія, деякі види азооспермії, симпатична офтальмія, також мають аутоімунний генез.
Слід зауважити, що при перерахованих вище захворюваннях аутоімунний генез ще остаточно не доведено.