При обробці матеріалу враховують високу розчинність ліпідів в органічних розчинниках. Тому користуються зрізами, отриманими на замораживающем мікротоми. Заливання в парафін і целлоидин провадиться лише за використання тих методів виявлення Л., при яких їх попередньо переводять в нерозчинне стан (наприклад, впливом біхромату калію). В якості фіксатора використовують формалін. Для збереження фосфатидів в розчин формаліну рекомендується додавати 1 % хлористого кальцію. У разі необхідності матеріал може бути залитий в желатину. Пофарбовані зрізи укладають у гліцерин, гліцерин-желатину та сироп фруктози.
Найбільш часто вживають такі методи виявлення Л. Забарвлення судановыми барвниками (судан III, шарлах червоний, судан чорний) проводиться для сумарного виявлення ліпідів; специфічність методу загальновизнана. Для визначення вільних жирних кислот застосовується забарвлення ниль-блаусульфатом, при якій жирні кислоти забарвлюється в синій колір, а нейтральний жир - рожевий, і реакція Фишлера, що дозволяє отримати синє фарбування жирних кислот (нейтральний жир не забарвлюється). Ненасичені жирні кислоти разом з іншими ненасиченими сполуками можуть бути виявлені методом Сміта - Дітріха. Менш перевірені для визначення жирних кислот метод Гоморі з застосуванням солей свинцю і сульфіду амонію і рекомендація Окамото (К. Okamoto) використовувати в реакції Фишлера не гематоксилін, а пара-диметил-аміно-бензаль-роданин. Реакції Шиффа і Главинда дозволяють виявляти продукти окисного перетворення нейтрального жиру - альдегіди і перекиси. Метод Бейкера - надійний спосіб виявлення фосфатидів. Можна використовувати також методи Чаччо і Меныпика, проте вони, мабуть, менш надійні. Пірс (Pearse A. ) пропонує використовувати для виявлення фосфатидів медьсодержащие фталоцианіни. Реакція Шультца для виявлення холестерину та його естерів найбільш поширена. Вільний холестерин добре виявляється реакцією з дигитонином.
Для визначення природи виявленої ліпіду велике значення має виборча екстракція окремих груп ліпідів тими або іншими розчинниками. Розроблена схема послідовної екстракції невеликих зразків з докраской судановыми барвниками [Кейлиг (J. Keilig)]. Окамото та ін. пропонують метод диференційованого визначення фосфатидів, цереброзидів, сфингомиелина і лецитину і окремо сфингомиелина, використовуючи нітрат ртуті та обробку дифенилкарбазоном. У всіх випадках гистохимического виявлення Л. доцільно проводити контроль ліпідної природи виявляються речовин. В якості розчинника, що видаляє всі Л., рекомендується підігріта суміш (1:1) метилового спирту І хлороформу.
