Перед вимірюванням перевіряють «електричний нуль», для цього закривають праву і ліву діафрагми. Якщо стрілка мікроамперметра не встановлюється на нуль, то її приводять до нульового положення за допомогою потенціометра на передній панелі приладу. Потім проводять вимірювання по одному з двох методів.
Перший метод. В правий пучок світла встановлюють кювету з досліджуваним розчином і встановлюють правий барабан на 100 за шкалою пропускання. У лівий пучок кювету не ставлять. Обертанням лівого барабана призводять стрілку мікроамперметра до нуля. Потім кювету з розчином заміняють такої ж кюветою з розчинником і відновлюють порушену рівновагу обертанням правого барабана. Оптична щільність відраховується з правого барабану.
Другий метод. Більш продуктивний, так як початкова установка приладу на 100 з розчинником може проводитися один раз для серії розчинів.
У правий і лівий пучки світла поміщають однакові кювети з розчинником. Правий барабан встановлюється на 100, а лівим зрівнюють світлові потоки. Потім кювету зліва замінюють на кювету з досліджуваним розчином. Порушену рівновагу відновлюють обертанням правого вимірювального барабана. Відлік проводять по правому барабану.
Як в фотоколориметрах, ФЕК-Н-57 і ФЕК-56, вимірювання каламутних розчинів проводиться опосередковано за світлопропускання каламутного щодо прозорого розчину або води, тобто також використовується принцип турбидиметрии. Саме вимірювання проводиться у тому ж порядку, як і з кольоровими розчинами.
Деяка незручність для користування цим колориметром в медичних лабораторіях пов'язано з тим обставиною, що в основному набір світлофільтрів відсутні часто застосовуються світлофільтри 490, 540 і 610 нм.
До фотоколориметрам ФЕК додається набір кювет з об'ємом від 0,5 до 40 мл, причому є кювети з товщиною робочого шару 100, 50, 30, 20, 10, 5, 3 і 1 мм. Харчування приладів ФЕК проводиться від мережі змінного струму 220 В через стабілізуючий пристрій.