Тривале вживання мінеральних вод, викликаючи підвищений діурез, призводить до вимивання солей з організму, причому одночасно відбувається «трансминерализация» тканин, коли солі мінеральної води замінюють солі організму. Одночасно можуть настати зсуви у кислотно-лужному балансі як у бік ацидозу, так і в бік алкалозу тканин. У зв'язку з цим при тривалому застосуванні гідрокарбонатних вод рекомендується стежити за змінами реакції сечі; при зсуві її у лужну сторону питне лікування відміняють через можливу при цьому фосфатурії.
Протипоказанням до питного лікування служать органічні деформації шлунка у вигляді стенозу воротаря, що ускладнюють просування мінеральної води і її всмоктування, значна эктазия шлунка, грубі порушення эвакуаторно-моторної функції, викликані іншими причинами,- пилороспазмом, деформацією дванадцятипалої кишки і т. д. Вимагають обережності в питному лікуванні кровоточиві виразки шлунка і дванадцятипалої кишки. Не слід призначати пиття мінеральних вод при гострих і загострених захворюваннях шлунка, кишечника і печінки, що виявляються блювотою, проносом, спастично больовим синдромом, жовтяницею і т. д.
Все ще недостатньо з'ясована роль питного лікування при нефриті і інших захворюваннях нирок.
В деяких сумнівних випадках питне лікування слід замінити іншими методами внутрішнього застосування мінеральних вод - промиванням шлунка або ректальними процедурами. У ряді випадків слід взагалі відмовитися від застосування мінеральної води.
