Існуючі погляди на патологічну анатомію шизофренії суперечливі. Одні автори заперечують наявність будь-яких типових патоморфологічних знахідок. Інші вважають, що є комплекс характерних саме для шизофренії макро - і микроизменений в головному мозку і в деяких внутрішніх органах, що в поєднанні з клінічними даними мають важливе значення в оцінці патологічного процесу в цілому і сприяють відмежування цього захворювання від інших психозів.
Макроскопічно в головному мозку померлих знаходять то більш, то менш помітні агональные явища набряку і недокрів'я мозку, зрідка невеликі атрофічні ділянки западання в корі, помірний фіброз м'яких мозкових оболонок, ще рідше окремі ознаки аномалій розвитку мозку.
Мікроскопічне дослідження показує, що в патологічний процес залучені кора головного мозку, підкіркові утворення, гіпоталамус (особливо нейрокринные елементи), стовбурові відділи і мозочок; найбільші зміни стосуються кори і підкірки. Найбільш виражені зміни в нервових клітинах і невроглии. Як правило, виявляють атрофічні зміни нервових клітин, їх зморщування, ліпоїдний склероз, надмірне накопичення ліпофусцину в їх цитоплазмі, а також гидропическую дистрофію, просте нисслевское згасання, гостре і важке захворювання, пряму і ретроградну дегенерацію, атрофію бічних придатків дендритів (шипиків). Максимум зазначених змін припадає на 3-й і 5-й шари мозкової кори, в результаті чого в корі, головним чином у онтогенетично молодих структурах її, утворюються мелкоочажковые, не пов'язані з судинами, випадання невронов без будь-якої помітної глиозной реакції. Виявляються ділянки демієлінізації тангенціальних і радиарных волокон, іноді різна ступінь набухання, здуття.
Дуже характерні зміни невроглии, особливо мікроглії (мезоглии), проявляються її морфо-функціональною недостатністю: зменшення кількості мікрогліоцитів, гіпоплазія їх. Вони насилу виявляються загальноприйнятими методиками забарвлення. Типова також неповноцінність микроглиальной реакції у відповідь на екзогенні шкідливості або ускладнюють основний процес ураження головного мозку. Ці особливості мікроглії пов'язані з недостатністю захисних реакцій ретикулоендотеліальної системи організму хворого шизофренією.
В цілому патоморфологія головного мозку укладається в картину токсико-гіпоксичної енцефалопатії. У гостро протікають випадки зі смертельними наслідками переважають виражені дисциркуляторні розлади в мозку і у внутрішніх органах. У роботах останнього часу є відомості про деякі відмінності в гистопатологической картині в залежності від типу перебігу шизофренії.
У внутрішніх органах нерідко виявляються status lymphaticus або thymico-lymphaticus, іноді значна щільність паренхіматозних органів за рахунок розростання строми. Нерідко знаходять гіпоплазію кардіоваскулярної системи (малі розміри серця, вузькість аорти).