В якості важливого доповнення до методу розпилювання заморожених трупів Пирогов перед замороженням часто застосовував ті чи інші прийоми з метою змінити співвідношення областей та органів, як це часто має місце в практиці. Так, наприклад, він змінював положення кінцівок, виробляючи потім розпили при згинанні, розгинанні, відведення і приведення у різних суглобах. Для уточнення топографії внутрішні органи Пирогов перед замороженням трупа наповнював шлунок або сечовий міхур водою, а кишки повітрям. Він вводив рідини в порожнини плеври й очеревини, щоб вивчити зміщення серця, спостережуване при плевриті, або черевних органів, що виникає при асциті. Пирогов наповнював водою
порожнини суглобів, а потім робив розпили через суглоби в різних напрямках. Він виробляв вивихи в суглобах, а потім розпили через вивихнуті відділи кінцівок. Таким чином, Н. І. Пирогов перший застосував у великому масштабі анатомічний експеримент.
Цим методом були виконані численні дослідження. Ще в минулому столітті були поставлені досліди на трупі з метою вивчення різних способів штучного дихання (С. Н. Делицин), штучного кровообігу і навіть штучного відтворення голосу. Останнє було зроблено проф. Д. І. Кошлаковым, учнем С. П. Боткіна; він перший не тільки відтворив на трупі голос різних відтінків, але й спостерігав на трупі вібрацію голосових зв'язок.
Досить ефективним виявився метод анатомічного експерименту для вивчення питання про шляхи поширення гнійної інфекції, гематом, натечников, сечової інфільтрації і т. п. Ми маємо цінними дослідженнями, проведеними за цим способом (А. В. Старков, А. А. Введенський, В. Ф. Войно-Ясенецький, останнім часом Н. В. Махов, Б. М. Хромов, К. Е. Архангельська, Н. П. Биржакова, В. П. Новіков та ін).
Експеримент на трупі дозволяє з достатньою переконливістю встановити доцільність тих чи інших оперативних прийомів. Так, Е. В. Сєрова, вивчаючи на трупі ефективність різних способів закриття відкритого пневмотораксу, вводила (після попереднього застосування плеври-м'язових швів, паракостальных швів, диафрагмо - і пневмопексии та інших прийомів) в порожнину плеври повітря і встановлювала за допомогою манометра то максимальний тиск, під яким перебував введений повітря (цим визначалася надійність того чи іншого методу герметизації порожнини плеври).
На живій людині співвідношення органів вивчаються шляхом вимірювань (соматометрия), рентгенографії (отримання рентгенівського зображення на знімку), рентгеноскопії (отримання рентгенівського зображення на екрані) та іншими методами.