Медицина в середні століття (період феодалізму, приблизно з 5 століття н. е..) носила різко різний характер у країнах Сходу (в основному в Азії) і Заходу (в основному в Західній Європі). Це стало наслідком великих відмінностей в економіці і загальної культури. Візантія (з кінця 4 до кінця 5 століття звалася Східної Римської імперією), пізніше виникли арабські халифаты, східнослов'янські землі, Київська Русь стояли в ранньому середньовіччі на значно більш високому рівні економічного та загальнокультурного розвитку, ніж країни Західної Європи. У країнах Сходу В період феодалізму знайшло продовження та розвиток медичне спадщину античного світу. У Візантійській імперії виникли великі лікарні для цивільного населення, одночасно вважалися притулками-богадельнями; тут же виготовлялися ліки. Перші відомі лікарні цього роду виникли в 4 столітті в Кесарії (Цезареї) і Севастії, у населеній тоді вірменами Каппадокії (області Малої Азії). У зв'язку зі значним поширенням у середні століття епідемій лікарні цього періоду переважно обслуговували заразних хворих (лазарети, ізолятори та ін).
В умовах панівного становища церкви в середні віки великі лікарні опинилися в її віданні і стали одним із засобів подальшого зміцнення впливу церкви.
Значний розвиток у середні століття на Сході медицина отримала у феодальних мусульманських державах - халифатах. Основною мовою спілкування між країнами Сходу, а також мовою культурної та наукової діяльності в них був арабська; звідси неточні позначення «арабська культура», «арабська наука», «арабська медицина» та ін. Ця багата культура творилася багатьма народами; араби серед них займали одне з перших місць. Широка торгівля як між халифатами, так і з іншими віддаленими країнами (Китай, Русь, країни Західної Європи і Африки), розвиток гірських промислів, обробка руди сприяли успіхам механіки, хімії, ботаніки, географії, математики, астрономії.
На цій основі виявилися можливими досягнення практичної медицини і медичної науки. Розвиток отримали лікознавство, лікування заразних хвороб, деякі елементи гігієни. Найвизначнішим на Сході лікарем, надали великий вплив на європейську медицину, був Ібн-Сіна (Авіценна, 980 - 1037), за походженням согдиец (согдійці - предки нинішніх таджиків і узбеків). Розквіт діяльності Ібн-Сіни відноситься до його перебуванню на початку 11 століття в Хорезмі. Визначним медичним твором Ібн-Сіни є енциклопедичний «Канон лікування», що охопила всі існуючі тоді галузі медицини. Зокрема, Ібн-Сіна розробив питання дієтетики за віком, деякі питання гігієни, значно збагатив коло застосовуваних ліків. Для лікування сифілісу він застосовував ртуть. Вільнодумство Ібн-Сіни стало причиною його переслідувань фанатиками ісламу. «Канон» поширився не тільки на Сході; на протязі багатьох століть в латинському перекладі він був одним з основних посібників вивчення медицини в університетах Західної Європи.
З медициною країн Сходу близько пов'язана передова медицина Закавказзя. У Вірменії в перші століття нашої ери виникли лікарні зі школами для лікарів, розводили лікарські рослини. Лікар М. Гераци (12-13 ст.) описав заразні хвороби, малярію. У Грузії існували наукові центри, де вивчалася медицина. Видатне місце належить академії в Галаті (поблизу Кутаїсі), заснованої на початку 12 століття Керівник її І. Петріци мав ряд учнів-лікарів. Збереглися рукописні трактати з медицини, складені грузинськими лікарями [Кананели (11 століття) та ін]. Лікарні, школи для лікарів, лікувальники були також в Азербайджані.
У Давньоруському феодальному державі, який досяг найбільшої могутності в 10-12 ст., поряд з нечисленними осередками церковного медицини в монастирях (під впливом Візантії) продовжувався розвиток давньої народної емпіричної медицини, популярною серед населення. У найбільш ранніх джерелах, містять опис побуту стародавніх слов'ян, зазначається поширене користування лазнею в оздоровчих цілях і для лікування. Літописцями згадується діяльність народних «лечцов», серед яких були і жінки. В містах (Новгород) були деякі елементи благоустрою - дерев'яні та гончарні водопровідні (або водовідвідні) труби, бруковані вулиці. Пізніше літописи повідомляють про заходи проти поширених епідемій: поховання мертвих за межами міст, заборона спілкування з «заморными місцями», застави з вогнищами під час епідемій, «запирання вулиць» (тобто ізоляція вогнищ) і годування в складчину ізольованих та ін ці Заходи знайшли подальший розвиток в Московській державі після звільнення від татаро-монгольського ярма і подолання удільної роздробленості. Розповсюджені лікувальники містили ряд раціональних наставлянь по лікуванню хвороб і побутовій гігієні, травники (зельники) - опис лікарських рослин. Ті й інші відображали досвід народної емпіричної медицини і досвід російських лікарів-професіоналів. Зустрічалися, особливо серед лікарів, також переклади, іноді з посиланнями на класичну літературу (Гіппократа, Галена та ін). Зазначається спеціалізація народних лікарів: «костоправи», «очні» лікарі, «кильные» (грижі), «камнесеченцы», «камчужные» (щодо лікування ломоти, ревматизму), «чечуйные» (за геморою), «чепучинные» (венеричних хвороб), бабки-повитухи, бабусі-цілительки дітей і ін.
На відміну від країн Сходу, середньовічна медицина в Західній Європі у зв'язку з пануванням церковної (католицької) схоластики характеризувалася уповільненим розвитком і значно меншими успіхами. У 12-14 ст. виникли перші невеликі університети в Парижі, Болоньї, Монпельє, Падуї, Оксфорді, Празі, Кракові та ін. Корпорації вчених і студентів мало чим відрізнялися від цехів ремісників. Головну роль в університетах грали богословські факультети, загальний устрій життя в них був подібний церковному. В області медицини основним завданням вважалося вивчення і коментування Галена, його вчення про потойбічне пневме і сили, про цілеспрямованості процесів в організмі (галенізмом). Розкриття допускалися лише у вигляді винятку. Фармація була тісно зв'язана з алхімією, марно шукала «життєвий еліксир», «філософський камінь» та ін. Лише три університету Західної Європи з практичним спрямуванням навчання відносно менше відчували вплив церковної схоластики - Салернский (поблизу Неаполя), Падуанський (поблизу Венеції), Монпельє (Франція).
У двох областях медицини, незважаючи на труднощі, пов'язані з пануванням схоластики, був накопичений в середні століття значний матеріал - з інфекційних хвороб та хірургії. Численні епідемії середніх століть викликали необхідність заходів проти них. Особливо важкою була змішана епідемія 14 століття, відома під назвою «чорна смерть» (чума, віспа, тиф та ін), коли в Європі загинуло до чверті населення, а в ряді великих міст у живих залишився лише кожен десятий. До 14 століття відноситься виникнення ізоляторів, карантинів у великих портах, установу у великих містах посад міських лікарів («фізиків»), видання правил - «регламентів» щодо запобігання занесення і розповсюдження заразних хвороб.
Накопичення знань у галузі хірургії пов'язане з численними війнами тієї епохи. У середні століття хірурги в Європі були відокремлені від вчених докторів і становили особливу, нижча верства. Серед хірургів розрізнялися різні категорії: власне хірурги різних розрядів, камнесеченцы, костоправи, цирульники. Нижчий щабель в цеху хірургів займали банщики і мозольного оператори. В окремих університетах у зв'язку з нагальною необхідністю були і вчені хірурги (у Болонському ун-ті, в Монпельє і ін). Придбавши великий досвід, особливо під час воєн, хірургія збагачувалася і переростала в науку. На відміну від внутрішньої медицини, вона не була обтяжена впливом церковної схоластики і галенизма.
До кінця середньовіччя суспільний розвиток у Європі викликало великі зміни в медицині. Поступове ослаблення феодальних відносин, визрівання і наростання нових, більш передових капіталістичних відносин привели до формування з ремісників і торговців нового класу - буржуазії і швидкому його зростання. В результаті зміцнення ремесел та їх об'єднання стали створюватися мануфактури, спочатку в Північній Італії, потім у Голландії, пізніше - в Англії і ін. Пошуки нових ринків для збуту товарів стали причиною далеких подорожей. Вони привели в кінці 15 ст. до великих географічних відкриттів Колумба, Магеллана, Васко да Гами та ін. Включилися в світовий оборот ізольовані до того обширні території з місцевими лікувальними засобами, традиціями емпіричної народної і професійної медицини (Південна і Центральна Америка та ін).
Новий клас, який прагнув оволодіти матеріальними багатствами, потребував розвиток нових галузей знань (в першу чергу механіки, хімії) для кораблебудування, гірської справи і багатьох галузей нарождавшейся промисловості. З цим пов'язано також розвиток математики, астрономії та інших наук.
Великий позитивний вплив на розвиток культури європейських країн у цей період мала культура середньовічного Сходу (так звана арабська) і відроджене спадщина античності: звідси термін «епоха Відродження», «Ренесанс».
В протилежність умоглядною і догматичної церковній схоластиці середньовіччя, отримали розвиток знання, засновані на спостереженні природи, на досвіді. Якщо в середні століття анатомія в західноєвропейських країнах була в занепаді і часто переслідувалася, широко поширений інтерес до анатомії став характерною рисою епохи Відродження. «Теорія лікаря є досвід»,- вчив Парацельс (1493-1541), хімік і різносторонній лікар (Швейцарія). Найбільшим анатомом епохи Відродження був падуанський учений А. Везалій (1514-1564). На основі численних розтинів він спростував ряд помилкових укорінених уявлень про будову тіла. Праця Везалія «Про будову людського тіла» (1543) поклав початок нової анатомії.
Таку ж роль у фізіології, що виникла слідом за анатомією, відіграла праця англійця Ст. Гарвея (1578-1657) «Про рух серця і крові у тварин» (1628). Гарвей - також учень Падуанської школи - довів кровообіг, застосувавши обчислення, методи експерименту і вівісекції. Відкриття кровообігу, як і книга Везалия, стало ударом по пережитків середньовіччя в медицині. У 16-17 століттях робилися також спроби вивчення обміну речовин (С. Санторіо).
Одночасно з анатомією і фізіологією на основі спостережень і досвіду отримала розвиток хірургія, найбільш видатним представником якої був французький цирульник А. Паре (1510-1590). Парі ввів у вживання (одночасно з Парацельсом і іншими передовими хірургами) раціональну перев'язку ран, відмовившись від їх припікання, перев'язку судин, що зробило можливим ампутації, винаходив ортопедичні прилади, нові інструменти та операції.
Лікування внутрішніх хвороб також придбала нові риси на основі збагатилися анатомо-фізіологічних знань і клінічного напряму. Перші видатні її представники - італійські, пізніше - голландські і англійські лікарі. Значне поширення заразних хвороб протягом середніх століть і пізніше призвело до накопичення великого досвіду, узагальненням якого з'явився працю падуанського вченого Д. Фракасторо «Про контагии, контагиозных хвороби та їх лікування» (1546). Він же одним з перших описав у ряді творів сифіліс, широко поширений в той час. У 17 столітті значно збагатив знання в області інфекційних хвороб, особливо дитячих, майстер клінічного спостереження, «англійська Гіппократ» - Т. Сиденгам (1624-1689). Найбільшим клініцистом дещо пізніше був голландський лікар і хімік Р. Бурган (1668 - 1738), який створив велику клінічну школу в Лейденському університеті. У Бургава було багато послідовників і учнів у всіх країнах Європи.
Не тільки медики відігравали роль в розвитку медичних знань. Видатний математик, фізик і астроном Р. Галілей активно брав участь у конструюванні першого термометра («термоскопа» - спіралеподібно зігнутої градуйованою скляної трубочки) та інших приладів, які отримали застосування в медицині. Він з'явився разом з голландцями (брати Янсен та ін) одним з перших конструкторів мікроскопів. Після Галілея конструював збільшувальні прилади й зробив ряд відкриттів голландський оптик А. Левенгук (1632 - 1723).
