Великі зміни в суспільному житті, зростання населення, особливо великих міст, запити з боку розвивалася торгівлі і промисловості тягли за собою збагачення різноманітних галузей знання і виникнення нових наук. Процес цей відбувався і в медицині.
На рубежі 17 і 18 ст. було опубліковано працю італійського вченого Б. Рамаццини (1633-1714) «Про хвороби ремісників» (1700). Праця ця, зазначений К. Марксом у «Капіталі», відбив у медицині риси нової епохи - посилення капіталістичних відносин, розвиток нових видів мануфактурної промисловості. Користуючись старим терміном «ремісники», Рамаццини описував і працю на мануфактурах. Ним було описано більш ніж 60 професій, їх вплив на здоров'я працюючих. Одночасно з систематичним описом численних шкідливостей у відомих йому видах праці Рамаццини шукав і вказував шляхи попередження цих вредностей. Спонукальним мотивом, як писав Рамаццини в передмові до книги, з'явився для нього моральний обов'язок лікаря сприятиме поліпшенню стану ремісників і робітників, що «...від праці яких, настільки важкої і брудної, але все ж необхідного, залежить безліч благ, якими користується людство». Праця Рамаццини поклав початок розвитку в подальшому нових галузей медицини - промислової патології і гігієни праці.
Велике значення мало виникнення в другій половині 18 столітті патологічної анатомії. Падуанський вчений Д. Б. Морганьї (1682-1771) узагальнив виконані ним численні розтину померлих у праці «Про місцезнаходження і причини хвороб, виявлених анатомированием» (1761). Праця Морганьї започаткував патологічну анатомію як наукової дисципліни. Нова наука підвела матеріальну основу під розпливчасте до того поняття хвороби, завдала цим удар по містичним, спекулятивних поглядів в медицині. Морганьї та інші основоположники патологічної анатомії дотримувалися локалістичних уявлень: вони вважали, що кожна хвороба викликає певні матеріальні зміни в окремих органах, гніздиться саме в них («органопатология»); розтин дозволяє ці зміни встановити точно.
У 19 столітті цей локалистический принцип був розвинений однобічно і перебільшений Р. Вирховом і його послідовниками, що привело пізніше до теоретичним і практичним помилок. Відомо, що кожна хвороба не обмежується локальною зоною її безпосереднього вияву; зазвичай її вплив позначається в тому чи іншому вигляді на всьому організмі в цілому («антропопатология»). Правильний науковий підхід вимагає в кожному випадку обліку приватного і спільного, їх співвідношення. Однак при виникненні і в перші десятиліття свого розвитку органопатология зіграла прогресивну роль: вона сприяла виявленню змін в організмі при різних захворюваннях і тим самим дала можливість постановки обгрунтованого діагнозу, до того гадательного, не пов'язаного з ясними уявленнями про порушення в організмі.
У Росії ще до появи праці Морганьї з початку 18 століття (див. вище) практикувалися розтину померлих у госпіталях. Матеріали розтинів дозволяли правильно трактувати зв'язок хвороб з конкретними анатомічними змінами.
В середині 18 століття була опублікована невелика книжка віденського лікаря Л. Ауенбруггера (1722-1809) «Нове відкриття - выстукивание грудної клітки людини як спосіб виявити приховані в грудній порожнині хвороби» (1761). Спочатку відкинуте і высмеянное науковими колами відкриття Ауенбруггера було в подальшому визнано і розроблено іншими вченими, зокрема французом Ж.-Н. Корвизаром (1755-1821) в 1808 р. у Росії выстукивание грудної клітки в кінці 18 століття застосовував А. О. Саполович. За выстукиванием було введення в 1819 р. вислуховування [Р. Лаэннек (1781-1826), Франція].
В подальшому в зв'язку зі зростаючими успіхами численних галузей природознавства темпи розвитку медицини прискорюються. Розвиток суспільного життя знайшло відображення в напруженій науково-філософської боротьби між матеріалістичними і ідеалістичними течіями. Ця боротьба знаходила відображення і в медицині.
Ідеалістичні течії в ній були представлені Р. Е. Шталем (Німеччина) - творцем системи анімізму, А. Галлером (Швейцарія, Німеччина), французькими лікарями-виталистами. Вони мали заслуги в окремих областях науки, але значення цих заслуг великою мірою було знижено їх помилковими загальними концепціями, подібно до того, як це сталося з Галеном.
З робіт французьких виталистов найбільше значення мали дослідження Т. Борді (18 століття) про функції залоз. Борді наблизився до розуміння внутрішньої секреції (статевих залоз). Разом з тим виталисты розвивали ідеалістичне вчення про «одухотворяющем життєвому принципі», який визначає життя організму. Виталисты заперечували єдність живої і неживої природи, бачачи тільки їх протилежні сторони.
До кінця 18 століття виникла і пізніше набула поширення гомеопатія - ідеалістичне вчення С. Ганеманна (1755 - 1843). Вчення це являло реакцію на безсилля терапії того часу; воно будувалося на положенні про застосування в лікуванні мінімальних доз ліків, значне їх розведенні, що ніби має сприяти виділенню особливих «прихованих сил» ліків, і на лікування «подібного подібним». Ганеманн вважав, що хвороба, представляючи розлад «життєвої сили», має нематеріальний, духовний характер. З-за непізнаваність, недоступності сутності хвороби лікувальна діяльність повинна в основному зводитися до усунення хворобливих симптомів.
Ідеалістичний течіям в медицині протистояли матеріалістичні течії. До них насамперед належать зачатки наукової гігієни, шукала засоби подолання хвороб на шляхах вивчення і усунення шкідливих впливів навколишнього матеріального середовища. Позитивну роль у розвитку гігієнічного напрямку в медицині зіграли працю Рамаццини (див. вище) і подальший розвиток патології і гігієни праці. Не меншу роль у зміцненні матеріалістичних уявлень грало розвиток патологічної анатомії та її застосування на практиці. Патологоанатомічні розтини давали розуміння матеріального субстрату хворобливих процесів, що міцно зв'язувала анатомію з клінікою.
Теоретичне, філософське узагальнення матеріалістичних уявлень в медицині дали французькі лікарі-матеріалісти. Ж. О. Ламеттри (1709-1751) - учень видатного клініциста Бургава, автор книг «Людина-машина», «Трактат про душу» та ін - дав матеріалістичне тлумачення процесів життєдіяльності людського організму і психічної діяльності. Йому довелося тікати з Франції від переслідувань духовенства. Інший чудовий лікар-матеріаліст і видатний діяч французької революції 18 століття. П. Ж. Кабанис (1757-1808) у творі «Відношення між фізичною та моральною природою людини» стверджував фізіологічне походження психічної життя і її формування під впливом навколишнього середовища. Кабанис був перетворювачем лікарняного справи та підготовки лікарів в дусі запитів нового часу: він боровся проти пережитків схоластики, стверджував клінічне викладання та експериментальне вивчення природничих наук.
