Характерні риси розвитку клінічної медицини найнаочніше виявляються в клініці внутрішніх хвороб.
М. Я. Мудров (1776-1831) розробив вчення, в якому формулював ряд загальних клінічних ідей. Погляди М. Я. Мудрова виражені у його лекції «Слово про спосіб вчити і вчитися медицині практичної або діяльному лікарському мистецтву при ліжках хворих» (1820). Розвиваючи погляди свого вчителя Ц. Р. Зыбелина (див. вище) про индивидуализированном підході до хворого, М. Я. Мудров визначив мету і зміст лікування як «лікування самого хворого». Етіологія більшості хвороб тоді не була відома, самі хвороби не були виділені як вивчені форми. Лікування «самого хворого», уважний облік індивідуальних особливостей хворого і його захворювання стали позитивної традицією вітчизняної клінічної медицини.
Мудров доводив, що хвороба не обмежується ураженням одного органу, а охоплює в тому чи іншому вигляді весь організм. Мудров наполягав на ретельному ведення історій хвороби, заповнюваних біля ліжка хворого, їх збереженні та подальшому використанні. В той час для впровадження клінічного напряму це вимога було дуже важливим. Ним розроблено детальний розпитування хворого, розвинений згодом московської терапевтичної школою.
Сучасник М. Я. Мудрова В. Е. Дядьковский (1784-1841) був клініцистом-терапевтом і мислителем-матеріалістом. В роки першої холерної епідемії (1830-1832) складені Дядьковским вказівки лягли в основу проводилися в Росії заходів. Їм вперше звернуто увагу на факт перенесення хвороби здоровими людьми. Дядьковский, излагавший систему матеріалістичних поглядів в медицині в умовах миколаївської реакції, у 1836 р. був усунений від викладання за спробу природничонаукового пояснення збереження в грунті «нетлінних мощей», у чому полягало блюзнірство. Першоджерело всього того, що відбувається в природі Дядьковский вважав за необхідне «...шукати не в силі і не в якомусь особливому початку, але тільки в матерії, як безумовної причини всіх явищ...» Життя, за Дядьковскому, є «постійне і безперервне взаємодія зовнішніх сил природи і внутрішніх - людського тіла». Ці ж погляди розвивав учень і послідовник Дядьковского К. В. Лебедєв. Подібні погляди висловлював клініцист-терапевт П. А. Чаруковский.
В основу розуміння життя організму в здоровому і хворому стані В. Е. Дядьковский поклав стан нервової системи, вважаючи її найважливішою. Погляди В. Е. Дядьковского та його однодумців були раннім виразом матеріалістичного нервизма (див. нижче). Вони представляли матеріалістичний напрямок, характерне для медичної думки в Росії.
Протягом 19 століття клінічна медицина все більше збагачувалася досягненнями різних галузей природознавства. Розвиток патологічної анатомії призвело до створення прозекторській діяльності, запровадження в обіг лікарні секційної. Успіхи хімії зробили можливими клінічні аналізи - спершу елементарні, потім більш складні, особливо з виникненням біологічної (фізіологічної, медичної) хімії (див. вище). Впроваджувалися фізичні методи дослідження хворого - выстукивание, вислуховування. Російські лікарі (А. О. Саполович - в 18 столітті, П. А. Чаруковский, Р. В. Сокольський, B. Герберский - в 19 столітті) були серед перших, взяли і впроваджували нові методи.
Ендоскопія, запропонована в 1807 р. італійцем П. Боцціні, дала можливість лікарю проникнути поглядом у порожнини тіла людини для цілей діагностики і терапії; виникли езофагоскопія, гастроскопія (А. Куссмауль, 1862; М. Нітце та ін), бронхоскопія та ін Стало входити в ужиток вимірювання температури тіла в клініці [А. Роже (Франція), Л. Траубе (Німеччина)]. Видатними представниками загальної терапії внутрішніх хвороб в середині 19 століття з'явилися чеський учений Й. Шкода і Л. Траубе. Нові вимірювальні прилади зробили можливим визначення кров'яного тиску, надалі електрокардіографію та ін.
