Проведені дослідження описані Пироговим у праці «Практичні та фізіологічні спостереження над дією парів ефіру на тваринний організм». У 1847 р. Н. І. Пирогов вперше застосував ефірний наркоз у військово-польовій практиці.
Величезна кількість смертей від зараження ран в клініці Медико-хірургічної академії спонукало Н. І. Пирогова вивчити фактори передачі зараження; він перший поділив приміщення для гнійної і чистої хірургії.
У домикробиологический період Пирогов М.І. близько підійшов до уявлень про медичної мікробіології. Не обмежуючись знезараженням на поверхні, Пирогів вимагав знезараження і в глибині рани.
Н. І. Пирогов став ініціатором удосконалення підготовки лікарів за його наполяганням була виділена в Медико-хірургічної академії на V курсі госпітальна хірургічна клініка. Цю пропозицію було поширено також на терапевтичну клініку.
Героїчну роботу провів Н. І. Пирогов у Кримську війну (1853-1856) в обложеному Севастополі, потім Сімферополі. Тут він вперше ввів жіночий (сестринський) праця у військово-польових умовах; застосував гіпсову пов'язку для іммобілізації; ввів раціональну сортування поранених, а також істотно поліпшив принципи евакуації; показав на практиці організацію роботи хірурга в умовах великої перевантаження; ввів вперше (при активній участі сестер) дієтичне харчування поранених і хворих. Н. І. Пирогов був прихильником і пропагандистом «ощадного» лікування - принципу, не соблюдавшегося більшістю хірургів в той час. Всього Н. І. Пирогов брав участь у чотирьох війнах, в тому числі російсько-турецької 1877-1878 рр. (див. нижче - Військова медицина). Один з основних його висновків - вирішальна роль належить попередження захворювань: «Я вірю в гігієну. От де полягає щирий прогрес нашої науки. Майбутнє належить медицині запобіжної». Спираючись на свій величезний досвід, Пирогов розробив оригінальне і цілісне вчення, сформулювавши його в 20тезисах («Основні початку моєї польової хірургії», у книзі «Військово-лікарська справа», ч. II). Свої нововведення Пирогову довелося здійснювати при опорі неосвіченою царської військової адміністрації, у боротьбі з казнокрадами, кар'єристами і т. д.
Великим хірургом-клініцистом і діячем громадської медицини в Росії був Ф. В. Іноземцев (1802-1869). У Московському ун-ті він заснував госпітальну клініку на V курсі, провів ряд заходів щодо поліпшення підготовки лікарів. Іноземцев заснував «Московську медичну газету», широко освещавшую питань громадської медицини, і Товариство російських лікарів у Москві.
Після інгаляційного наркозу великим успіхом хірургії було введення місцевої анестезії. Фізіологи судовий медик Б. Анреп (1852-1918) виявив у 1879 р. знеболюючу дію кокаїну. Введення місцевого знеболювання в повсякденне хірургічну практику при тодішньому стані техніки інгаляційного наркозу дозволило значно розширити коло оперативних втручань.
Надзвичайною проблемою хірургії була боротьба з інфекцією ран. Її дозвіл почалося з введення антисептики і асептики. Одним з попередників хірургічної антисептики був угорський акушер В. Земмельвейс (1818 - 1865). Він встановив в 1847 р. причину «пологової лихоманки», приводила до смерті величезне число породіль. У Віденському пологовому будинку він став виконувати елементарні гігієнічні заходи - ретельну прання і кип'ятіння білизни і предметів догляду, знезараження рук лікарів і студентів миттям їх в розчині хлорного вапна. Це призвело до різкого зниження кількості смертей. Відкриття Земмельвейса було відкинуто найвизначнішими акушерами та визнано тільки після його смерті.
