Знеболювання експериментальних тварин досягається тими ж методами, які застосовують у клінічній хірургії.
Вибір методу анестезії залежить від ряду факторів. При необхідності швидкого або негайного виведення тваринного стану анестезії після операції краще інгаляційні способи наркозу. При операціях на печінці протипоказані барбітурати, які не можуть застосовуватися і при кесаревому розтині у зв'язку з токсичним впливом їх на плід. Цей вид знеболювання небажаний і при операціях на старих або ослаблених тварин. У той же час барбітурати є незамінними при багатьох операціях на дрібних тварин. Вони порівняно безпечні, забезпечують хороше розслаблення м'язів без додаткового введення релаксантів. Період пробудження після введення барбітуратів відносно тривалий.
Після введення барбітуратів наркоз незворотній, у зв'язку з чим потрібні велика обережність і точність дозування при їх введенні.
Методи інгаляційного наркозу вимагають певного навику наркотизатора та відповідного обладнання. Інгаляційний наркоз переноситься тваринами важче, ніж барбитуратный, у зв'язку з великою витратою енергії на дихальні рухи і напруга мускулатури.