Ця концепція не відкинута остаточно і зараз, хоча добре відомо, що в тканинах тварин і мікроорганізмів (дріжджів) роль кінцевий оксидази виконує зовсім інший і єдиний фермент - цитохромоксидазу; вона міститься в тканинах рослин і володіє значно більшою спорідненістю до кисню, ніж фенолоксидаза і пероксидаза. Отже, є всі підстави думати, що і в тканинах рослин цитохромоксидазу відіграє головну, якщо не виняткову роль на кінцевому етапі тканинного дихання. Але цитохромоксидазу не потребує фенолах в якості кофакторів. Отже, роль фенолів як кофакторів дихання незрівнянно скромніше, ніж здавалося Палладину, Опаріну, Сент-Д'єрдьї та іншим вченим. Лише в певних умовах вони у комбінації з відповідними ферментами грають роль у нормальному окисному обміні. Так, наприклад, у бульбах картоплі основний оксидазою є фенолоксидаза.
Є ще один дуже серйозний аргумент проти визнання за фенолоксидазой (або пероксидазою) в комбінації з фенолами важливої ролі в нормальному диханні рослин. Справа в тому, що в нормі основна частка енергії, що звільняється при окисленні, витрачається на біосинтез інших сполук. Щоб використання цієї енергії стало можливим і зручним, вона запасається у формі фосфатних з'єднань (наприклад, АТФ - аденозинтрифосфату). Для звичайної дихальної ланцюга, закінчується цитохромоксидазой, добре відомо пару з окислювальним фосфорилюванням - системою запасания енергії у вигляді АТФ. А для фенолоксцдазной і пероксидазної систем таке сполучення невідомо. Це не означає, що його немає взагалі. Але якщо воно й існує, то серйозної ролі не грає.
Достовірно відома лише роль убихинонов, що грають роль переносників водню в дихальної ланцюга мітохондрій на ділянці між флавопротеинами і цитохромами.
Можливо, що в якості проміжних ланок дихального ланцюга виступають і інші вбудовані в мембрану мітохондрій фенольні кофакторы: α-токоферол (вітамін Е) і фитилнафтохинон (вітамін K1), здатні до оборотного окислення.
Споріднені за своєю структурою убихинонам, фенольні кофакторы беруть участь у перенесенні водню в процесі фотосинтезу. Цей процес протікає в хлоро-пластах, і пластохінони грають в нім важливу роль. Мабуть, і інші феноли (імовірно флавоноїдної природи) беруть участь у цьому процесі, істотно збільшуючи швидкість пов'язаного з фотосинтезом фосфорилювання. Запрометову і Колонкової (1967 р.) вдалося показати, що катехіни і кверцетин синтезуються в хлоропластах і, отже, виконують в них якісь фізіологічні функції, пов'язані із здійсненням фотосинтезу.
Деякі фенольні сполуки, такі, як йодований фенол - гормон щитовидної залози тироксин, а також кемпферол, кверцетин, флоридзин, можуть гальмувати окисне фосфорилювання, тимчасово роз'єднувати дихання і фосфорилювання. Неясно, чи мають вони для цього попередньо перетворюватися в хінони.
Нарешті, фенольні сполуки можуть використовуватися рослинними клітинами нарівні з цукрами як просто «горючого матеріалу», джерела енергії. Запрометов ще в 1959 р. показав, що мічені катехіни, як введені в пагони чайного рослини, так і синтезовані в них, в основному згоряють і виділяються у вигляді вуглекислоти. Час напіврозпаду простих катехінів становить близько 50 год, а їх з'єднань з галової кислоти - 70 ч. Ці дані підтвердили і інші дослідники.
Таким чином, не тільки мікроорганізми, але й рослини здатні розщеплювати ароматичні ядра і використовувати накопичену в них енергію в своїх інтересах для різноманітних процесів життєдіяльності.
