Чим же практично відрізняється гіпнотичний сон від звичайного фізіологічного? У стані нормального, звичайного сну людина однаково несприйнятливий до яких би то не було звуків, що виходять від зовнішнього середовища, навколишнього світу; його звуковий аналізатор охоплений процесом гальмування, розлитим по корі великих півкуль головного мозку і найближчої підкіркової області. Людина, занурений у глибокий гіпнотичний сон, також не віддає собі звіту в тому, де він перебуває, не реагує на присутніх лікарів, але при цьому виявляє надзвичайно загострену чутливість до голосу лікаря-гіпнотерапевта, йому одному відповідає уві сні.
При гіпнотичному сні аж ніяк не вся кора головного мозку охоплена процесом гальмування. Та обмежена область звукового аналізатора (орган слуху) в корі, яка пов'язана зі сприйняттям голоси лікаря і його навіювань, продовжує діяти, зберігається так званий «сторожовий вогнище збудження». Наявність цього сторожового вогнища дає можливість збереження особливого зв'язку між загипнотизированным і гіпнотизером-лікарем - так званого «рапорту». У явищах цього своєрідного «рапорту» в гіпнотичному стані немає нічого особливого, незвичайного. Сторожовий вогнище нерідко буває навіть при особливих умовах і в звичайному сні. Наприклад, солдати на фронті після тривалих боїв, будучи вкрай втомленими, сплять і не чують сильних сторонніх шумів, звуків, розривів снарядів, але варто пролунати словами команди командира, вимовленим навіть пошепки, і вони негайно ж прокидаються, так як в слуховому аналізаторі кори головного мозку у них залишався ізольований «сторожовий вогнище збудження», що сприймає слова команди, які виходять від офіцера.
В іншому випадку загальновідомий факт, коли мати, стомлена безсонними ночами біля ліжка хворої дитини, задрімала на кілька хвилин і не чує гучних звуків, шумів, співу в сусідній квартирі, музики, але варто тільки трохи заплакати її хворій дитині, як вона негайно прокидається, так як в її корі зберігся осередок збудження, що зберігає її зв'язок, своєрідний «раппорт» між матір'ю і дитиною.
Щось подібне спостерігається і в тваринному світі. Нерідко можна спостерігати, як ціле стадо спить і не чує сторонніх звуків. Не спить лише сторожове тварина, пильно охороняючи все стадо. Ось з'явилася небезпека, і сторожове тварина дає сигнал тривоги! Все стадо негайно прокидається і тікає від небезпеки. Механізм цього зв'язку той же, у мозку тварин зберігається «сторожовий вогнище збудження», який і підтримує зв'язок між сторожовим тваринам і всім іншим стадом.
Виходячи з вищесказаного, можна зробити основний висновок, що гіпнотичний сон близький до фізіологічного і є модифікацією звичайного, природного сну. Ось чому так вигідно і корисно застосовувати його з лікувальними цілями.