Секреція шлунка може спостерігатися при попаданні в нього не тільки харчових речовин, але і чужорідних тіл (гумові кільця, тверді предмети тощо), однак секреція в цьому випадку буде не харчова, а отвергаемая. Вона може супроводжуватися появою тошнотного стану, виникненням антиперистальтических рухів і завершиться блювотою.
Моторна діяльність шлунка забезпечує перемішування харчової маси і евакуації вмісту зі шлунка. У перший час після прийому їжі моторна діяльність шлунка ослаблена, але в міру просочування харчової маси шлунковим соком вона починає посилюватися і виражається в періодично виникаючих і наступних одна за іншої перистальтичних хвиль, які в подальшому дедалі частіше завершуються відкриттям пілоричного сфінктера. Внаслідок цього невеликі порції вмісту шлунка переходять в кишечник. Відкриванню сфінктера також сприяє подразнення області сфінктера з боку шлунка, тоді як роздратування цим же кислим вмістом сфінктера з боку кишечника викликає негайне закриття сфінктера і він залишається в такому стані до тих пір, поки потрапила в кишечник харчова маса повністю не нейтралізується.
При прийомі їжі в шлунок часто надходить велика кількість води або вода може відділятися від харчового продукту, як це буває, наприклад, при створаживании в шлунку молока під впливом ферменту химозина. Присутність зайвої кількості води може розбавляти шлунковий сік і цим ускладнювати процес перетравлення. Для запобігання цього в шлунку існує спеціальний водяний жолоб, розташований на малій кривизні, за яким надлишки води видаляються в кишечник.
Вміст шлунка порціями надходить у дванадцятипалу кишку, де піддається подальшому перетравленню. Це перетравлення відбувається під впливом ферментів соку підшлункової залози і кишечника. Секреція підшлункової залози відбувається під впливом як нервового механізму, так і специфічного гормону секретину, який утворюється у слизовій оболонці дванадцятипалої кишки під впливом соляної кислоти, яка надходить разом вміст шлунка. У слизовій оболонці дванадцятипалої кишки також утворюється гормон, що впливає на утворення ферментів підшлункової залози, - панкреозимин. Уламки білка, що надходять зі шлунка в кишечник у вигляді пептонів, зазнають подальшого переварювання під впливом ферменту соку підшлункової залози - трипсину (активованого энтерокиназой кишкового соку), а також ферменти кишкового соку - эрепсина і доводяться до амінокислот. Вуглеводи також продовжують перетравлюватися тут в слабо лужному середовищі під впливом амілази, мальтази, лактази та інших ферментів кишкового соку, соку підшлункової залози.
Жири перетравлюються також у кишечнику під впливом ферменту ліпази, кишкового соку, соку підшлункової залози. При цьому в перетравленні та у всмоктуванні продуктів переварювання жиру бере участь жовч. Жовч також відноситься до травних соків. Вона починає виділятися в кишечник через загальний жовчний протік через 20 хв. після прийому молока і 30 - 40-50 хв. після прийому хліба і м'яса. При цьому жовчовиділення пов'язується не з прийомом їжі, а з початком надходження хімусу зі шлунка в кишечник і обумовлено рефлекторним впливом з поверхні кишки на сфінктер загальної жовчної протоки (сфінктер Одді) і скороченням м'язів стінки жовчного міхура. Вплив жовчі виражається в тому, що вона емульгує жири, активує ліпазу і сприяє розчиненню жирних кислот.
В даний час підтверджується існування в кишечнику особливого, так званого пристінкового, травлення. Суть цього процесу полягає в тому, що завдяки наявності ворсинок, а в зв'язку з цим і величезної поверхні виникають сприятливі умови для адсорбції ферменту (амілази) стінкою кишки і для посилення ферментативної реакції в цій області.
У тонкій кишці травлення завершується процесом всмоктування поживних речовин (див. Всмоктування). По мірі всмоктування і подальшого переміщення вмісту кишечника відпрацьовані шлакові речовини надходять в товсту кишку; тут відбувається всмоктування води і формування калу. Остаточне формування калу завершується в прямій кишці, а заповнення її ампули викликає відповідне подразнення і позив до акту дефекації.
