Впровадження блідої трепонеми в організм відбувається через дрібні дефекти шкіри і слизових. Існувала думка, що на поверхні мацерированной шкіри в теплі бліді трепонеми можуть розмножуватись і проникати в шкіру. Ця можливість залишається недоведеною і малоймовірною. Рівним чином малоймовірна можливість впровадження блідих трепонем через непошкоджені фолікули шкіри. Впровадження трепонем через неушкоджені слизові більш імовірно. Броун і Пірс (Brown і Pearce) вводили заразний матеріал в неушкоджену вагіну кролиці, у кон'юнктивальний мішок і показали, що цим може бути викликано зараження. Можливо проникнення інфекції через неушкоджену слизову людини - залишається неясним. Практично неможливо виключити дрібні ушкодження епітелію, відкривають ворота інфекції.
Доводиться, однак, в цьому разі визнати, що інфекція проникає в організм, не залишаючи на місці проникнення клінічно помітних ознак. Часте відсутність при самому ретельному огляді воріт інфекції у жінок до певної міри говорить про таку можливість.
Потрапляючи в організм, бліді трепонеми швидко проникають у лімфатичні щілини, а звідти розносяться по організму. Вже з перших моментів зараження треба вважати сифіліс загальним захворюванням. Ряд дослідників (Броун і Пірс, Цургелле, Колле) показав в експерименті, що інфекція може бути виявлена через найкоротші терміни в регіонарних залозах. Цей термін в деяких дослідах Колле становив у кроликів 30, а у морських свинок - всього 5 хвилин. Інші дослідники наводять терміни до 2 діб (Броун і Пірс). Якщо не можна проводити аналогії між інструментальним пошкодженням тканини при експериментальному зараженні тварин і зараженнями при статевому контакті у людини, то все-таки з клінічних спостережень безсумнівно, що інфекція дуже швидко потрапляє в струм крові, проникає в організм. На підставі дослідів на мавпах Нейссер вважав, що вже після 8 годин інфекція не може бути зупинена навіть висіченням обширних ділянок на місці щеплень.
Гістологічні дослідження показують, що вже через дві доби після щеплень кролику трепонеми у великій кількості просуваються в лімфатичні щілини тканин, поширюючись навколо щепленого шматочка. Вже в перші дні та години інфекція може потрапляти в кровоносну систему і переноситися у віддалені ділянки тіла. Цим «раннім эмболиям» можливо зобов'язані своїм походженням специфічні ураження внутрішніх органів і нервової системи в ранньому, первинному періоді сифілісу. Таким чином, місцями розмноження трепонем є: 1) місце їх впровадження, де вони інтенсивно розмножуються після впровадження в організм; 2) найближчі лімфатичні шляхи і регіонарні залози; 3) окремі осередки, які можуть виникнути в найрізноманітніших ділянках тіла у вигляді ранніх емболій.
Лімфатичні залози є не тільки бар'єром для блідих трепонем. Незабаром після зараження в регіонарних лімфатичних залозах виявляється безліч трепонем, велика кількість яких вже говорить про їх розмноженні в цих органах. В лімфатичних залозах інфекція гніздиться особливо наполегливо. Саме в лімфатичних залозах бліді трепонеми наполегливіше протистоять специфічному лікуванню і переживають довше, ніж в інших тканинах. Залози є тією тканиною, яка дає найбільше число вдалих щеплень. Ділянкою, де розмножуються трепонеми, є також місце їх первинного впровадження в організм - первинний афект; там інфекція може завзято протистояти специфічному лікуванню.
Патологоанатомічне вивчення лімфатичної системи у осіб, уражених сифілісом, показує, що по мірі розвитку патологічного процесу (сифілісу) лімфатичні шляхи уражаються все далі і далі. Після поразки регіонарних лімфатичних залоз уражаються лімфатичні шляхи і залози живота і грудей, аж до головного грудного протоку. По ходу розвитку сифілітичного процесу в залозистих тканинах виникають ендо - і перилимфангоиты, склерадениты.
Масивне надходження блідих трепонем у кров, як правило, здійснюється через лімфатичну систему.
Проникаючи з місця первинного афекту в організм, бліді трепонеми проникають в шкіру, викликають реакцію, яка виражається в перші дні деякої набряком сполучнотканинних волокон, збільшенням кількості фібробластів, збільшенням розмірів цих клітин, новоутворенням кровоносних капілярів. Бліда трепонема розташовується в сполучній тканині між клітинами і волокнами, але виявляється і в просвіті лімфатичних і кровоносних судин, в їх стінках. Інфільтрат на місці впровадження інфекції розвивається вже пізніше. Значне новоутворення капілярів характерно для первинного афекту вже на самих ранніх стадіях, і це, ймовірно, полегшує можливість потрапляння інфекції в кровоносну систему (ранні емболії). Паралельно з кровоносними збільшується і кількість лімфатичних судин.
Бліді трепонеми виявляються і в оболонках нервів. Деякі автори стверджують, що, просуваючись уздовж нервових волокон, інфекція може досягати спинних гангліїв.
В середньому близько 3 тижнів протікає до моменту клінічного виявлення первинного афекту. Це необхідно для розмноження блідих трепонем і їх пристосування до нових умов існування. Необхідно деякий час для розвитку реактивних явищ макроорганізму.
