Тривале лікування гормональними препаратами, особливо чистими прогестинами або містять естрогенний компонент, чинить негативний вплив на функцію печінки, підшлункової залози, шлунку, стан слизової оболонки товстої кишки - вона стає легкоранимої, з'являються виразки. Крім того, тривала гормональна терапія чинить негативний вплив на імунну систему, знижується неспецифічна опірність організму. Особливо несприятливий вплив на імунну систему і мікрофлору товстої кишки надає поєднання тривалої гормональної терапії з інтенсивної антибактеріальної терапією, що проводиться, з приводу хронічного коліту та запального процесу статевих органів (протягом ряду років ендометріоз яєчників і іншої локалізації приймають за рецидивуючий запальний процес і призначають антибактеріальні препарати). В результаті у хворих, як правило, розвивається дисбактеріоз кишечника, а потім може бути і кандидоз кишечника, органів сечовивідної системи і піхви. Дисбактеріоз і кандидоз надають виражене негативний вплив на імунну систему, неспецифічну опірність організму і слизову оболонку товстої кишки, розвивається неспецифічний виразковий коліт.
У розглянутому аспекті становлять інтерес результати досліджень Е. Wallce і співавт. (1977), які встановили, що тривалий прийом оральних контрацептивів (естроген-гестагенів, що застосовуються для лікування ендометріозу) навіть у здорових жінок тягне за собою підвищення рівня холестерину в 3 рази, а тригліцеридів - у 5 разів. Порушується і вуглеводний обмін (діабетогенное дію). Якщо ж у пацієнток вже був порушений ліпідний і вуглеводний обмін, як це має місце при ендометріозі, то метаболічні відхилення стають ще більш вираженими, що має певне значення в патогенезі пухлинних процесів.
Стійка гіпертензія, з'являється і підтримувана під впливом гормональної терапії у поєднанні з анаболічною дією - надлишкової збільшенням маси тіла та іншими метаболічними порушеннями - доповнює комплекс факторів, що привертають до раку ендометрія, а може бути, і іншої локалізації.
І ще одне положення. При дослідженні зв'язку розвитку злоякісних меланом з прийомом оральних контрацептивів (ОК) одночасно враховувалася можливий вплив близько 20 інших факторів, однак статистично значущими виявилися прийом ОК більш 4 років, високий вміст естрогену і вік перевищує 35 років [Beral V. et al., 1974].
Відомо, що в патогенезі раку молочної залози, крім дисфункції гіпоталамо-гіпофізарно-яєчникової системи, певне значення надається ожиріння, цукрового діабету та стресових станів, вкрай негативно впливає на нейроендокринну систему та гомеостаз організму в цілому. У хворих ендометріозом стресових станів виявляється більш ніж достатньо, якщо врахувати болісні болі, повторювані з місяця в місяць протягом багатьох років. Інтенсивність та тривалість болю наростають. У подальшому розвиваються невротичний синдром з вегетативною лабільністю, астеноневротичний, а потім і астеноипохондрический синдроми. І ось, незважаючи на важкі страждання, пацієнткам не завжди вірять і відмовляють у видачі лікарняного листа в періоди загострення захворювання. На цьому тлі вкрай несприятливий вплив має застосування естроген-гестагенних препаратів з метою контрацепції та/або лікування ендометріозу, особливо при наявності гіперпластичних процесів у молочних залозах продуктивного характеру з проліферацією.