Витягнуті з трупа органів оглядають, вимірюють і зважують, відзначають їх консистенцію, кровонаповнення, виразність малюнка, колір, стан крові в судинах і порожнинах серця, запахи, стан серозних і слизових оболонок, судинних стінок.
Якщо виникає підозра на наявність пневмотораксу, то ще до розтину грудної порожнини у заглиблення, утворене після відділення шкірного клаптя на грудній клітці, наливають воду і під водою роблять прокол в одному з міжреберних проміжків. Вихід бульбашок повітря є позитивним результатом проби.
При підозрі, що був проведений кримінальний аборт, а також при нез'ясованих випадках раптової смерті, що настала у жінок у молодому і середньому віці, необхідно проводити пробу на повітряну емболію серця. Методика проби наступна. Серединний розріз шкірних покривів починають не від підборіддя, а від рукоятки грудини. Відділення грудини виробляють на рівні друге міжреберних проміжків. Потім розкривають околосердечную сумку. Краї розрізу піднімають і порожнину сумки заповнюють водою так, щоб серце повністю перебувала під водою. Через шар води роблять прокол передньої стінки серця праворуч. Вихід бульбашок повітря є позитивним результатом проби.
Послідовність розкриття органів трупа при припущенні наявності отруєння має ряд особливостей. При зовнішньому огляді досліджують найменші пошкодження на поверхні тіла, ретельно оглядають усі природні отвори. Особливу увагу звертають на наявність слідів від ін'єкцій.
При внутрішньому дослідженні доцільно спочатку провести огляд грудної і черевної порожнин. Розтинають перикард і серце, з якого беруть кров, потім розкривають шлунок і кишечник. На шлунок біля входу і воротар накладають по дві лігатури, потім його виймають і розкривають по малій кривизні в окремій скляному або фарфоровому посуді. Так само розкривають кишечник. Досліджують стан стінок і слизової оболонки шлунково-кишкового тракту, вміст. Відзначають його кількість, густоту, колір, загальний вигляд, рН та ін. Після розтину шлунково-кишкового тракту досліджують інші внутрішні органи.
Судово-медична експертиза трупа супроводжується, як правило, застосуванням відповідних лабораторних методів дослідження - гістологічного, судово-хімічної, біологічної, бактеріологічної, ботанічної, фізико-технічного та ін.
Мікроскопічне дослідження органів і тканин особливо важливо проводити при раптовій смерті, гострих інфекційних захворюваннях, для встановлення прижизненности пошкоджень та їх давностей і т. д. Шматочки органів і тканин для гістологічного дослідження вирізають обережно, гострими інструментами. Частини тканин і органів для гістологічного дослідження повинні відповідати наступним вимогам:
1) матеріал повинен бути взятий так, щоб у нього була включена і патологічна, і незмінена тканина, тобто вирізають шматочки уражених тканин з захопленням здорових ділянок;
2) у вилучається препараті повинні бути всі верстви органу;
3) розміри шматочків повинні забезпечувати надійну фіксацію, тому оптимальна товщина не повинна перевищувати 0,5 см, площа повинна складати приблизно 2X2 см;
4)при взятті частин з органів, які мають капсулу, доцільно, щоб ця капсула входила до зріз органу.
Шматочки фіксують у 10 % розчині формаліну або в інших фіксуючих рідинах. Частини тонкостінних органів перед фіксацією закріплюють на картоні. Обсяг фіксуючої рідини повинен не менше ніж у 10 разів перевищувати обсяг взятих для дослідження шматочків. Банку з об'єктами постачають етикеткою, на якій вказують номер і дату укладання, прізвище, ім'я, по батькові померлого, перелік шматочків, взятих для дослідження, та ін. У супровідному документі коротко викладають обставини смерті, результати розтину, патологоанатомічний або судово-медичний діагноз, вказують мету дослідження. При необхідності подають копію висновку.
При насильницькій смерті, яка супроводжується зовнішнім кровотечею, а також при дослідженні трупів невідомих осіб і новонароджених в обов'язковому порядку в судово-біологічну лабораторію направляють кров з порожнини серця або великих кровоносних судин для встановлення її групової та типової приналежності. Якщо кров підлягає тривалому транспортуванні або не може бути досліджена протягом доби, то її беруть на марлю і підсушують при кімнатній температурі. При знекровленні трупа або його загнивання для цих цілей доцільно брати м'язову тканину.