Повне судово-медичне дослідження трупа передбачає обов'язкове розтин не менше трьох порожнин - грудний, черевний і порожнини черепа. Крім того, обов'язково досліджують порожнину рота, тканини і органи шиї, м'язи, кістки. У необхідних випадках досліджують хребетний канал, придаткові пазухи черепа, великі суглоби.
Існує кілька методів розтину трупа. В залежності від конкретних умов експерт вправі обрати спосіб, що забезпечує повноту і якість дослідження.
Дуже важливо при судово-медичному дослідженні трупа дотримуватися послідовності дій. При виборі порожнини, з якої починають внутрішнє дослідження, слід керуватися даними зовнішнього огляду та відомостями, отриманими при ознайомленні з обставинами настання смерті. При наявності пошкодження дослідження, як правило, доцільно починати з тієї порожнини, або частини тіла, де воно розташоване.
Основний розріз шкіри для розтину грудної і черевної порожнин виробляють від підборіддя до лобка (з обходом пупка зліва). Застосовуваний для цієї мети реберний ніж утримують горизонтально з тим, щоб розріз проводили його черевцем. Розріз проводять безперервним рухом, він повинен проникати через шкіру, підшкірну клітковину, досягаючи в області грудної клітки і грудини, а в області живота - м'язів. Рани, рубці, сліди хірургічних операцій необхідно при цьому обходити. Переважніше застосовувати Т-подібний, так званий воротникообразный розріз, що йде під ключицями (від одного плечового суглоба до іншого), а від середини цього розрізу - донизу до лобка з подальшим отсепаровыванием (без серединного розрізу) шкіри шиї.
Після проведення розрізу шкіри розкривають черевну порожнину. Шкірно-м'язові клапті на грудях після розтину черевної порожнини отсепаровывают в обидві сторони так, щоб оголилися ребра. Прямі м'язи живота вище або нижче пупка перерізають в поперечному напрямку, що розширює доступ у черевну порожнину. Її оглядають послідовно зверху вниз. При наявності пошкоджень, пухлин, сторонніх накладень та ін. зазначають їх локалізацію, розміри, форму, характер ранових каналів та ін. Звертають увагу на наявність, характер і запах випоту, оглядають органи малого тазу. На трупах жінок звертають увагу на стан матки і придатків. Перевіряють рівень стояння куполів діафрагми по відношенню до ребер. Якщо раніше на органах черевної порожнини проводилася операція, то ретельно досліджують операційне поле. Описують кількість, точне розташування і стан накладених швів.
Після огляду черевної порожнини перетинають грудинно-ключично зчленування і хрящові відділи ребер. По видаленні грудини відкривається широкий доступ в грудну порожнину. Органи оглядають на місці, після чого виймають з трупа і для подальшого вивчення поміщають на препаровальный столик.
Існує різний порядок дослідження органів. Можна вивчати їх систем, розкриваючи спочатку серце і судини, потім органи дихання, травлення та ін. Застосовують також дослідження органокомплекса за «розташування» - спочатку розкривають органи, розташовані в його дорсальній частині, а потім розташовані спереду. Найбільш зручним є поділ органокомплекса при його дослідженні на органи порожнини рота і шиї, органи грудної порожнини та органи черевної порожнини.
При дослідженні органів порожнини рота і шиї вельми бажано, крім мови, мигдалин, щитовидної залози, досліджувати внутрішні яремні вени, загальні сонні артерії, блукаючі і діафрагмальні нерви, а також симпатичні стовбури. При пошкодженнях шиї зазначені дослідження проводять в обов'язковому порядку.
Дослідження серця починають з вимірювання його до розтину. При цьому визначають найбільшу довжину, ширину, товщину і масу серця. Вінцеві артерії доцільно досліджувати як на поздовжніх, так і поперечних зрізах, що. дозволяє отримати повне уявлення про характер ураження вінцевих артерій, наявності або відсутності на внутрішній поверхні артерій елементів атеросклеротичного ураження, звуження просвіту та ін. Після розтину порожнини серця необхідно дослідити стан стулок і клапанів, виміряти периметр клапанних отворів, описати характер сосочкових м'язів і сухожилкових ниток, а також м'язи серця в різних відділах.
При дослідженні органів травної системи необхідно у всіх випадках докладно описати вміст шлунка і кишечника.
Після розрізу та огляду м'яких покривів черепа, розпилу і відділення кісток черепа вивчають головний мозок, звертаючи увагу на тверду мозкову оболонку, її кровонаповнення судин і синусів, а також на стан м'яких мозкових оболонок. Досліджують артерії основи мозку, кору великих півкуль, внутрішню капсулу, бічні шлуночки, амонію ріг, гіпофіз і шишковидну залозу. Після видалення твердої мозкової оболонки оглядають основу черепа, при необхідності розтинають придаткові пазухи.