Але найчастіше гонокок може просуватися по сім'явивідних протоках і викликати запалення насінних бульбашок і придатків яєчок (епідидиміт), а також по вивідним протоках передміхурової залози, викликаючи запальні процеси в цьому дуже важливому для статевого життя органі.
Після запалення придатків і сім'явиносних проток, особливо при ураженні з обох сторін, чоловік нерідко залишається безплідним (при двосторонньому запаленні придатків яєчок безпліддя настає у 90% хворих), так як протоки можуть зарости і стати непрохідними для насіння, однак здатність до коитусу при цьому зберігається. Гонорейний запальний процес в передміхуровій залозі також сприяє безпліддя і негативно позначається на статевій функції. Хворі зазвичай скаржаться на недостатність ерекцій, швидке виверження сімені, болі при еякуляції. При затяжних хронічних простатитах нерідко розвивається статева неврастенія. Гонококи можуть триматися в простаті до півроку, а іноді і по кілька років.
У тяжких і запущених випадках, при тривало протікаючих запальних процесах в сечовипускальному каналі, внаслідок змін слизової оболонки і підслизового шару стінки каналу, утворюються рубцеві звуження, що ускладнюють проходження сечі, а іноді і сперми.
Гонокок може проникати в сечовий міхур і навіть по сечоводах до нирок, але це буває дуже рідко, так як сеча для гонокока - середовище несприятлива.
Потрапляючи в око, гонококи викликають важке захворювання очей - бленнорею (від грец. «бленнос» - слиз і «рео» - течу). При пізньому розпізнавання цього захворювання або при відсутності належного лікування вона іноді веде до повної сліпоти, що в дореволюційний час спостерігалося нерідко у новонароджених, які заражалися від хворих гонореєю матерів під час пологів. У дорослих зараження очей може відбуватися забрудненим гноєм руками або рушником. Бленнорея в Радянському Союзі зустрічається дуже рідко, так як жінки у нас в основному народжують тільки в лікувальних установах, де всім новонародженим в очі, а дівчаткам і у піхву звичайно закапують розчин ляпісу, вбиває гонококів.
Кожен хворий на гонорею має бути під спостереженням лікаря до тих пір, поки не буде остаточно встановлено, що він здоровий. А перед вступом у шлюб хворів раніше гонореєю (якщо навіть це було давно) повинен обов'язково пройти ретельне обстеження свого здоров'я у лікаря-спеціаліста.
Перебіг гонореї у жінки внаслідок більш складної будови її статевого апарату відрізняється багатьма особливостями. Перші ознаки хвороби у жінки, як правило, бувають настільки незначними, що не привертають уваги і залишаються непоміченими, хвороба тривалий час залишається нерозпізнаною. І в цьому обставині криється дуже велика особиста і громадська небезпека: упускається період для своєчасного лікування, крім того, жінка, не підозрюючи про наявність у неї гонореї, продовжує вести статеве життя, залишаючись тривалий час джерелом зараження. Жінка майже ніколи не може вказати час свого зараження (початку захворювання), у той час як у чоловіка хвороба проявляється в перші ж дні (біль, різь, гній) і змушує його йти до лікаря. Понад 60-70% жінок, хворих хронічною гонореєю, відчувають себе взагалі здоровими. Млявий перебіг гонореї у жінок нерідко буває пов'язано з недостатньою функцією яєчників, із зменшенням виділення ними естрогенів.
Жінкам треба бути дуже уважними до себе. При самих незначних явищах, особливо після підозрілої статевого зв'язку, завжди краще здатися лікареві жіночої консультації або венеролога, тим більше це не потрібно відкладати, якщо з'явилися хоч незначні білі, незвичайний свербіж і печіння в статевих органах, що відчуваються всі трясучи або при сечовипусканні.