Гонококи у жінки в першу чергу проникають у її сечівник та оточуючі його залози, іноді в протоки бартолінових залоз, а також у шийковий канал матки. Однак піхви у зрілої у статевому відношенні жінки, з-за особливої структури його епітеліальної оболонки, гонорея не зачіпає. Гонорейні вагініти зустрічаються лише у маленьких дівчаток і у вагітних жінок.
Гостра гонорея жінки проявляється насамперед гнійними виділеннями з сечовипускального каналу і роз'їдають піхвовими виділеннями (белями). При сечовипусканні спостерігається легка різь. У неохайних жінок виділення можуть потрапляти і в задньопрохідний отвір, викликаючи нерідко гонорейное захворювання прямої кишки (проктит).
При несприятливих умовах і необережному лікуванні, при порушеннях режиму, встановленого лікарем, гонококи з шийки матки можуть просунутися на слизову оболонку матки і навіть в труби і яєчники (висхідна гонорея). При цьому у хворих підвищується температура, порушується нормальний цикл місячних, з'являються сильні болі, що супроводжуються рясними белями, іноді і матковою кровотечею.
При несвоєчасному і недостатньо енергійному лікуванні хвороба нерідко переходить у хронічну форму, для якої характерні мізерні слизові або слизово-гнійні виділення, в яких далеко не завжди можна виявити гонококів.
Хронічна форма гонореї у жінки триває дуже довго, періодично загострюючись, для неї характерна наявність прихованих періодів, під час яких гонококи знаходяться тільки в залізистих ходах і в глибоких шарах слизової. На поверхні ж слизової вони можуть з'явитися під час менструації, а іноді і під час сильного статевого збудження, при якому рясно виділяється слиз з дрібних залоз статевого апарату, і гонококи виганяються з свого притулку. Ось чому жінка, яка страждає прихованою формою гонореї, не при кожному статевому акті може заразити чоловіка.
Виділення прихованих гонококів сприяють тривалі та повторні статеві акти, особливо вчинені в стані сп'яніння, при якому еякуляція сповільнюється і подовжується період збудження. Крім того, при тривалому статевому акті відбувається більш тривале зіткнення здорових статевих органів з хворими, у результаті чого полегшується передача інфекції від хворої особи здорового. При незначних кількостях виділень у жінки вони можуть і не потрапити на статеві органи чоловіка, і він не заразиться.
В період менструації і відразу після її закінчення може наступити загострення прихованого хронічного гонорейного процесу, і жінка, раніше не заражавшая, стане небезпечною, заразливою. Цим і пояснюється той факт, що чоловік, який мав раніше багато статевих актів з однією і тією ж жінкою і не яка заразилася на, може раптово від неї ж заразитися.
Таким чином, жінка, роками будучи носієм гонорейної інфекції, може періодично ставати передавачем хвороби. Більшість заражень гонореєю відбувається саме в ці приховані періоди. При цьому жінка і сама іноді не знає про наявність у неї хвороби, наявність якої встановлюється вже після зараження нею чоловіка.
До ускладнень гонореї у жінки відносяться запалення матки, труб і яєчників. Просування гонококів у верхні відділи статевого апарату жінки може відбуватися при бурхливому статевому акті, коли в матці і трубах відбуваються антиперистальтичні скорочення (матковий рефлекс), втягують в її порожнину інфікований секрет шийки, при менструації, а також при пологах і операції аборту. Запальні процеси можуть призвести до утворення рубців і спайок в трубах і яєчниках. Ці ускладнення можуть стати причиною тривалого порушення менструацій, позаматкової вагітності, тимчасового, а іноді і абсолютного безпліддя жінки. При запальних процесах слизової внутрішньої оболонки матки вагітність часто закінчується викиднем.