В епоху феодалізму краніотомія розроблялася лікарями арабської медицини. Автори медичних книг того періоду рекомендували у випадках важких пологів при наявності мертвого плоду зменшувати обсяг головки. Операція прориву головки застосовувалася порівняно часто. Арабська школа створила для виконання краніотомії цілий ряд необхідних інструментів. Ібн Сіна (Авіценна) найбільш повно узагальнив погляди арабських лікарів у книзі «Канон лікарської науки» і детально описав техніку операції як при передлежачої, так і при подальшій голівці. У випадках гідроцефалії плода він рекомендував зменшувати розміри голівки шляхом випускання гидроцефалической рідини. Ібн Сіна велику увагу приділяв перебігу післяпологового періоду у жінок, пологи яких закінчувалися плодоразрушающими операціями. Він вважав обов'язковим призначати таким роділлям протизапальні та кровоспинні засоби.
Плодоразрушающіе операції, в тому числі і краніотомія, порівняно часто застосовувалися аж до XII століття. В середині століття в Європі краниотомию майже не застосовували. Породілля при патологічних пологах надавалася «божої волі». Церква загрожувала вічними муками за вигнання (умертвіння) плода. Р. Р. Арутюнян (1946) вказує, що в середині століття у Вірменії плодоразрушающіе операції здійснювали лише при наявності мертвого плоду або в тих випадках, коли життя матері загрожувала смертельна небезпека. У той період у Вірменії відкидалася сама думка про можливість збереження життя матері ціною смерті плода. «Ніхто не наважиться губити дитини (в утробі) заради порятунку життя матері. Нехай помре мати, але не дитина». Така точка зору була наслідком поширеного погляду церкви, що якщо дитина помирала нехрещеною, то разом з ним гинула та його «божественна» душа.
З епохи Відродження (XVI століття) починається період бурхливого розвитку акушерської науки. До цього періоду відносяться перші спроби наукової розробки операції краніотомії.
У зв'язку з тим, що в XVI столітті французький акушер Ambrois Pare (1550) знову ввів в акушерську практику операцію акушерського повороту, що значно обмежило застосування плодоразрушающих операцій, краниотомию стали виробляти значно рідше. Операція акушерського повороту, здавалося, була тим засобом, яке дозволяло при патологічних пологах обійтися без плодоразрушающих операцій, в тому числі і краніотомії. У той період акушери виробляли перфорацію головки тільки мертвого плоду. При наявності живого плода вони вичікували його загибелі і тільки після цього вдавалися до прободению головки. В цей же час почали знову застосовувати кесарів розтин.
В XVII столітті були винайдені і впроваджені в практику акушерські щипці. З введенням операції накладання щипців число плодоразрушающих операцій значно зменшилася, хоча при тривалих пологах, як і раніше вдавалися до краніотомії. У цей період ще більше поширення отримує операція брюшностеночное кесаревого розтину.
У XVIII столітті, яке характеризувалося загальним культурним і науковим прогресом, медицина збагачується новими відкриттями. Удосконалюються і окремі розділи акушерства і гінекології. Так, в 1777 р. була вперше проведена симфизеотомия, яка, на думку акушерів того часу, повинна була різко скоротити показання до застосування краніотомії, особливо на живому плоді. Прагнучи отримати живий плід, акушери нерідко протиставляли краніотомії інші акушерські операції, як акушерський поворот, накладання щипців, тазорасширяющие операції кесарів розтин.
