Незабаром була змінена структура і оснащеність польовий медслужби: кінний транспорт залишився лише в полковому ланці, інші медичні установи (польові госпіталі поки частково) були
переведені на механізовану тягу; замість кількох громіздких медичних установ дивізії був створений єдиний медико-санітарний батальйон (МСБ), що включає лікувальні, протиепідемічні, санітарно-хімічні та евакуаційні засоби і развертывающий в бою ДМП; в стрілецьких батальйонів були створені сан. взводи (з лікарем на чолі), а в полку - сан. роти, развертають в бою відповідно батальйонні та полкові медпункти (БМП та ПМП). Вся евакуація, починаючи з ПМП і до головного ж.-д. станції, відтепер повинна була здійснюватися автосанитарным транспортом МСБ і армійських автосанитарных рот («на себе»).
Проведена реорганізація отримала перевірку у 1938-1939 рр. на Далекому Сході при відбитті агресії японської вояччини і в 1939-1940 рр. під час радянсько-фінляндського конфлікту.
На основі цього досвіду були внесені суттєві корективи в систему медичного забезпечення бойових дій військ. Винесення поранених з поля бою був організований безперервно в ході бойових дій, що вимагало високої виучки низової ланки медслужби. Очевидною стала і недоцільності евакуації легкораненых по шляхах підвозу, що унеможливлювало своєчасне надання їм кваліфікованої допомоги. Виявилося марним перебування лікаря в батальйоні, де медичні заходи неминуче обмежувалися наданням долікарської допомоги та організацією виносу поранених з поля бою. ПМП, що розташовувалися в межах артилерійського, а часом і кулеметного вогню противника, вимушено обмежувалися наданням невідкладної першої лікарської допомоги та забезпеченням транспортування поранених на ДМП, що дозволило скоротити особовий склад і оснащення сан. рот. Зате незмірно зросло значення ДМП як «головної операційної військового тилу, де піддається хірургічній обробці переважна більшість поранених. Все це вимагало посилення МСБ хірургічними силами і матеріальними засобами. Дивізійні шпиталі були вилучені з дивізій і передані арміям. Була організована спеціалізована медична допомога.
Колективом авторів за участю Н. Н. Бурденко було розроблено «Посібник з військово-польової хірургії», засноване на єдиному розумінні походження та перебігу поранень і єдності методів їх лікування. Вийшли друком підручники з військово-польової хірургії (М. Н. Ахутина, П. А. Купріянова і С. В. Банайтиса, Н. Н. Єланського та ін); підручники з тактики медичної служби (Б. К. Леонардова, А. Ф. Вишневецького); були опубліковані монографії, численні журнальні статті і т. п. Це сприяло успішній військово-медичної підготовки лікарів в переддень другої світової війни. У 1940 р. при начальнику ГВСУ був створений Вчена медична рада, що зіграв велику роль у розробці системи лікування поранених і хворих та протиепідемічного забезпечення військ.
В 1940-1941 рр. розроблялось «Наставление по санітарній службі Червоної Армії». Це повчання містило ряд прогресивних положень. У ньому передбачалася евакуація поранених «за призначенням», починаючи з ДМП, на той етап медичної евакуації, де їм по характеру і ступеня тяжкості поранення може бути надана необхідна медична допомога, що забезпечувалося наявністю в розпорядженні начмедарма спеціалізованих груп посилення і автохирургических загонів. Встановлювалися також безперервність виносу поранених з поля бою, зосередження польових госпіталів у розпорядженні начмедарма та ін.