Партія керувала цією боротьбою в центрі і на місцях. Лікарі були наділені надзвичайними повноваженнями. Вироблялися дієві заходи, створювалися надзвичайні комісії по боротьбі з епідеміями, система ізоляційно-пропускних пунктів та карантинів на ж.-д. станціях і пристанях; в найкоротші терміни була розгорнута широка госпітальна мережа, яка забезпечила ізоляцію і лікування хворих; був створений потужний банно-пральний апарат, потяги лазні і поїзди-пральні; до протиепідемічної роботи широко залучалася громадськість, небаченого розмаху набуло сан. просвіта. В результаті протиепідемічної боротьби, яка була, за словами 3. П. Соловйова, «наполегливим і кровопролитним штурмом», була здобута життєво важлива перемога. У вирі цих подій виникла і почала розвиватися нова галузь військової медицини - військова епідеміологія, ініціатором виділення якої в самостійну дисципліну був Д. К. Заболотний.
У період мирного будівництва перед радянської військової медицини виникли важливі завдання щодо оздоровлення праці і побуту військовослужбовців. Керівник радянської військово-медичної служби 3. П. Соловйов висунув принцип гармонійного поєднання лікувальних та профілактичних заходів; він вважав, що лікар зобов'язаний вивчати причини, що викликають захворювання, з тим щоб разом з лікарями частин усувати їх. Військовий лікар повинен вивчати умови праці та побуту військовослужбовців, активно разом з командуванням домагаючись поліпшення фізичного стану особового складу та усунення факторів, що перешкоджають цьому.
Поєднання лікувальної та профілактичної діяльності знаходило відображення в методах диспансеризації, покладеної в основу лікувально-профілактичної роботи у військах. Лікування хворих забезпечувалося широкою мережею гарнізонних, окружних, центральних госпіталів і поліклінік, надавали військовослужбовцям всі види медичної допомоги. У 1922 р. на Кавказі і в Криму були засновані перші військові санаторії, мережа яких в подальшому швидко зростала.
Інтенсивно розвивалися наукові основи військової медицини, особливо військової гігієни та військової епідеміології. Виділилися і нові галузі військової медицини - фізіологія військового праці та авіаційна фізіологія. Розвивалися санітарно-хімічний захист, військово-санітарна адміністрація і санітарна тактика. У 1922 р. було організовано Санітарне відділення Військово-наукового товариства (САНОВНО) з філіями в округах і гарнізонах. З'явилася (1924) спеціальна періодична література: «Військово-санітарний збірник», «Військово-санітарний журнал» (на Україні), «Бюлетень» (в Приволзькому військовому окрузі).
У 1923 р. було видано перший радянський допомога по санітарної тактики - структурні схеми організації військово-санітарних установ. Ці схеми відображають прийняту тоді систему етапного лікування з дренажного типу (послідовна евакуація поранених з одного етапу на інший - від роти до розподільного евакопункту внутрішнього району країни). Дещо пізніше (1925) вийшов підручник П. І. Тимофіївського за санітарної тактики, що витримав чотири видання. До цього часу стає особливо ясним, що для того, щоб грамотно організувати медичну допомогу пораненим в бойовій обстановці, «військовий лікар повинен бути добре орієнтований в тактиці і стратегії, повинен знати умови, в яких діють війська і в яких протікає медичне забезпечення». «Заперечувати це або брати під сумнів,- казав 3. П. Соловйов,- означало б заперечувати самий факт існування і все більш прогресуючого розвитку військової медицини в її теорії і практиці».
У відповідності з цим було переглянуто Положення про Військово-медичної академії, введені військова дисципліна, табірні збори для слухачів, дворічна прикомандирование лікарів до академії. Для удосконалення керівних працівників медичної служби організовується відрядження на курси при Військовій академії ім. Фрунзе. У 1924 р. в медичних вузах була введена вища допризовна підготовка. У 1929 р. ГВСУ було виведено з підпорядкування Наркомздоров'я і включено до складу Наркомвійськмора. У тому ж році вийшло Керівництво по санітарної евакуації в РСЧА», законодавчо затвердила безперервність, послідовність і наступність медичної допомоги на етапах медичної евакуації (тобто етапне лікування), принцип «евакуація на себе», зачатки прогностичної сортування в цілях обмеження евакуації легкораненых та ін.