За останній час все більшого значення в діагностиці набуває метод біопсії слизової оболонки кишечника. Біопсія є методом, в основі якого лежить вивчення структури слизової оболонки, що дає можливість у кожному конкретному випадку уточнювати морфологічні особливості захворювання на мікроскопічному рівні. До впровадження в клінічну практику методу аспіраційної біопсії кишечника (Royer та ін., 1955) прижиттєвому морфологічному дослідженню на мікроскопічному рівні піддавалася тільки слизова оболонка дистального відділу товстої кишки. Біопсія цього відділу кишечника здійснювалася через ректороманоскоп за допомогою пристрою у вигляді щипчики під контролем ока.
Принцип аспірації слизової оболонки за останні 15 років значно розширив можливості біопсії. Удосконалено інструментарій, а також розроблено нові методи дослідження одержуваного матеріалу, зокрема використання електронного мікроскопа, а також гістохімічних та біохімічних методів дослідження слизової оболонки. Розвиток методів дослідження одержуваного біопсійного матеріалу дає можливість не тільки уточнити характер структури тонкої кишки, але дозволяє судити і про функціональний стан останньої.
В даний час існують три види інструментів для проведення біопсії слизової оболонки дванадцятипалої і тонкої кишки і один - для біопсії дистального відділу товстої кишки. Найбільш поширені напівтверді одноканальні биопсионные зонди, засновані на принципі конструкції зонда Wood з співавторами (1949), запропонованого для проведення біопсії слизової шлунка (Ц. Р. Масевич, 1964, 1967; Shiner, 1956). Запропоновані легко сгибаемые биопсионные зонди, теж одноканальні, але без спіралі і троса всередині. Ніж у биопсионной капсулі відсікає тканину або за допомогою пружини (Crosby, Kugler, 1957), або за рахунок перепаду тиску ззовні і всередині капсули при створенні вакууму (М. Думеш, 1965). Третій вид інструментів для проведення аспіраційної біопсії - це двоканальні, теж легко сгибаемые зонди. Біопсійний ніж у них приводиться в рух рідиною і нею ж шматочок слизової оболонки вимивається назовні (Heiming з співавт., 1959, та ін). Інструмент для проведення аспіраційної біопсії товстої кишки влаштований за тим же принципом - це биопсионная капсула на кінці жорсткої трубки, всередині якої проходить трос (Truelove з співавт., 1955; В. К. Герасимов і Ц. Р. Масевич, 1964; А. Р. Саакян, 1968). Інструмент вводиться через ректороманоскоп, і тим самим досягається прицільна біопсія.
При виборі інструмента для взяття біопсії слід врахувати таку обставину. Чим менше одержуваний шматочок слизової оболонки, тим безпечніше проведення біопсії. З іншого боку, занадто малі шматочки слизової не можуть служити достатнім матеріалом для повноцінного морфологічного (гистохимического) укладення. Величина отримуваних шматочків слизової оболонки залежить від величини отвору в биопсионной капсулі, ступеня створюваного при біопсії вакууму і тривалості його дії. Спеціально проведені спостереження (Ц. Р. Масевич, 1967) показали, що оптимальними умовами для проведення біопсії слизової оболонки тонкої кишки є діаметр круглого отвору в биопсионной капсулі, рівний 2,5 мм, і негативний тиск - 280-300 мм рт. ст., що підтримується протягом двох секунд. При дотриманні цих умов проведення біопсії безпечно і виходять шматочки слизової оболонки вагою 20-28 мг, достатні для гістологічного (гистохимического), так і для біохімічного дослідження.
За даними морфологічного дослідження слизової оболонки тонкої кишки, одержуваним з допомогою аспіраційної біопсії, можна судити тільки про дифузних змін. Поряд з цим, серійні дослідження, проведені в одного хворого (множинні біопсії з різних місць тонкої кишки), показали (Heinkel з співавт., 1962), що можливі й вогнищеві патоморфологічні зміни. Сказане справедливо і щодо одного шматочка слизової оболонки. Патоморфологічні зміни можуть спостерігатись інколи лише у окремих ворсинках. У зв'язку з цим при судженні про морфологічних змінах за даними біопсії основне значення мають позитивні знахідки. Наявність нормальної слизової оболонки в даному препараті не виключає можливості патоморфологічних змін у прилеглих ділянках кишки.
