При станах голодування, коли запаси глікогену в печінці виснажуються, ферментні системи гепатоцитів здатні перетворювати в глюкозу продукти розщеплення білків - амінокислоти (неоглюкогенез). Таким чином, печінка підтримує постійний рівень глюкози в крові: надлишок глюкози (після прийому багатої вуглеводами їжі) видаляється з крові печінкою і запасається у формі глікогену. При зниженні рівня цукру в крові гепатоцити знову перетворюють глікоген у глюкозу і виділяють його в кров.
У гладкому ЕР здійснюється перетворення жовчного пігменту (білірубіну) і деяких інших сполук у розчинну у воді, здатну до екскреції в жовч форму. Важливою функцією гладкого ЕР є також переробка і знешкодження різних токсичних (отруйних) хімічних сполук, що надходять в організм ззовні чи утворюються в процесі обміну речовин. Наприклад, високотоксичний для клітин аміак, що утворюється в кишечнику при розкладанні бактеріями білків їжі, перетворюється в гладкому ЕР гепатоцитів в порівняно нешкідливу сечовину, виділяється нирками з сечею. Тут же знаходиться найважливіша ферментативна система, метаболизирующая лікарські засоби, і друга за значимістю (після АДГ-цитозолю) ферментативна система, oxidizing алкоголь. Найважливішими складовими частинами систем, що здійснюють детоксикацію ліків і алкоголю є цитохром Р-450 - білок, що входить до складу гему, і ферменти - монооксідази (редуктази), здійснюють численні окислювально-відновні реакції, а також перетворення різних розчинних у жирах (ліпідах) і нерозчинних у воді сполук на водорозчинні, тобто здатні до видалення з організму в таких водних розчинах як жовч, сеча. При тривалому введенні в організм надмірних кількостей переробляються в гладкому ЕР сполук (наприклад, деяких ліків або високих доз етилового спирту) ця органелла здатна значно збільшувати свій об'єм у клітині печінки і різко активізувати свої обмінні функції. Цей процес носить назву ферментативної індукції. Він супроводжується збільшенням розмірів печінкових клітин печінки в цілому.
Апарат Гольджи є видільної органеллой клітини. В гепатоцитах він розташований поблизу ядра, в області цитоплазми, що межує з жовчним канальцем (у біліарного полюса); складається з освічених мембранними структурами сполучених трубочок і бульбашок (мішечків), в яких накопичуються білкові і вуглеводні сполуки (секрети), призначені для виведення з клітини або для побудови компонентів зовнішньої клітинної мембрани. Ці продукти виділяються з клітини шляхом екзоцитозу, тобто отпочковивання від мішечків маленьких бульбашок, наповнених экскретируемыми з речовинами клітини.
Деякі відокремлені від апарата Гольджи секреторні пухирці діаметром близько 0,5 мкм, оточені ліпопротеїнової мембраною, залишаються всередині клітини. Їх називають лизосомами (грец. lisis - розчинення; soma-тіло). Рідина, укладена в лізосомах, містить набір гідролітичних ферментів, здатних розщеплювати клітинні білки, ліпіди, нуклеїнові кислоти і т. д. Ферменти лізосом синтезуються в гранулярном ЕР. В лізосомах перетравлюються і готуються до видалення з клітки різні чужорідні органічні частинки (наприклад, бактерії) і пошкоджені або зношені клітинні органели та їх фрагменти. Завдяки оболонці ферменти лізосом не переварюють навколишні їх клітинні структури, однак при пошкодженні або загибелі клітини, наприклад, через нестачу кисню, оболонка лізосом стає порозной, що містяться в них ферменти проникають у цитоплазму і руйнують збереглися клітинні органели. Цей процес носить назву аутолізу.
